Notice: Only variables should be assigned by reference in
上記は、php5からphp7への移行でwordpressのテーマが出したNoticeです。
function.phpの中に、参照渡しで値を配列に渡している
$comments_by_type = &separate_comments($_commnets);
このようなコードがあったために注意を受けてしまった模様。
参照渡しを使わなければいいので
$comments_tmp = separate_comments($_commnets);
$comments_by_type = $comments_tmp;
こうしたら解決しました。